Liittohallitus johtaa liittoa liittokokousten välillä. Hallitus koostuu sekä jäsenjärjestöjen että paikallisosastojen edustajista. Vuonna 2023 hallituksessa on 16 jäsentä, joista kolme ovat puheenjohtajiston jäseniä (puheenjohtaja ja kaksi varapuheenjohtajaa). Vaikka hallitus periaatteessa koostuu kuudesta varsinaisesta jäsenestä ja viidestä varajäsenestä, emme tee käytännössä eroa varsinaisen jäsenen ja varajäsenen välillä. Hallitus on tiimi, jossa kaikki saavat olla mukana ja osallistua työskentelyyn. Liiton sääntöjen mukaan liittohallituksessa tulee olla 6-10 varsinaista jäsentä ja 4-6 varajäsentä.
Hallitus kokoontuu tavallisesti noin kymmenen kertaa vuodessa. Hallituksen kokouksissa, jotka pääasiassa järjestetään Helsingissä, hallitus päättää mm. liiton taloudesta, työntekijöiden palkkauksesta, tapahtumista ja tavoitteista. Hallituksen tehtäviin kuuluvat myös kaikki yhdistyslaissa mainitut yhdistyksen hallitukselle kuuluvat tehtävät.
Hallitus vuodelle 2024 on kokonaisuudessaan:
Puheenjohtaja: Nette Rimpioja / Suomen Nuorisovaltuustojen Liitto
Varapuheenjohtajat:
Siiri Turunen / Kokoomuksen Nuorten Liitto
Taru Nekkula / Helsingin Nuorten Pohjola-Norden
Hallituksen jäsenet:
- Erik Halttunen / Kokoomusopiskelijat
- Cecilia Huhtala / Finlands Svenska Skolungdomsförbund
- Sara Nyman / Vihreät Nuoret
- Polina Tashinova / Helsingin Nuorten Pohjola-Norden ry
- Vilhelmiina Vierijoki / Helsingin Nuorten Pohjola-Norden ry
- Vilhelm Vähäsilta / Suomen Lukiolaisten Liitto
Hallituksen varajäsenet:
- Saska Kolehmainen / Helsingin Nuorten Pohjola-Norden ry
- Elina Riutta / Varusmiesliitto
- Hawa Sesay / Suomen YK-Nuoret
- Markus Yli-Kivistö / Varusmiesliitto